Superkomputer tercepat di dunia sedang digunakan oleh para peneliti dalam upaya untuk mengidentifikasi pengobatan baru untuk Covid-19.
Proyek penelitian dipimpin oleh tim dari Universitas Tokyo, yang akan menggunakan mesin (disebut Fugaku (terbuka di tab baru)) untuk mensimulasikan interaksi molekul secara massal, dengan tujuan mengidentifikasi senyawa yang dapat digunakan untuk melawan infeksi.
Dikembangkan bersama oleh Fujitsu dan Institut RIKEN, Fugaku juga akan digunakan untuk “mengklarifikasi mekanisme molekuler yang menghambat infeksi Covid-19”, yang dapat membantu mengoptimalkan struktur molekul obat baru, sehingga meningkatkan kemanjurannya.
Superkomputer Fukagu
Dibangun pada prosesor Fujitsu A64FX berbasis Arm, Fugaku mengungguli 500 Teratas (terbuka di tab baru) peringkat superkomputer pada Juni 2020. Ini mencapai 415,5 petaFLOPS oleh benchmark Linpack Kinerja Tinggi (HPL), hampir tiga kali lipat skor IBM Summit, pemegang rekor sebelumnya.
Fugaku juga berada di puncak tangga lagu untuk beban kerja Grafik 500, HPL-AI, dan HPCH; suatu prestasi yang belum pernah dicapai sebelumnya di dunia komputasi kinerja tinggi (HPC).
Sejak saat itu, pengenalan 330.000 inti lebih lanjut (meningkatkan total menjadi 7.630.848) telah meningkatkan kinerja mesin lebih jauh lagi, menjadi 442 petaFLOPS.
Dengan kata lain, saat ini tidak ada mesin lain di planet ini yang mampu mendekati kinerja yang dicapai oleh Fugaku, yang berarti diposisikan secara unik untuk membantu penelitian dan penemuan obat.
“Dengan memanfaatkan Fugaku, simulasi molekuler untuk protein virus dapat dipercepat, mengklarifikasi kompleksitas keadaan pengikatan dan interaksi antara protein virus dan senyawa penghambat, dengan tujuan mengidentifikasi senyawa penghambat yang dapat mengarah pada obat terapeutik pada tahap awal,” jelas Fujitsu .
Superkomputer juga akan digunakan untuk memprediksi perilaku dan sifat mutasi Covid-19, yang dapat menjadi ancaman serius untuk kembali ke kehidupan normal jika mampu menghindari panen vaksin saat ini.
Dengan mengidentifikasi potensi pola mutasi, peneliti dapat merancang obat terlebih dahulu, bahkan sebelum galur baru muncul di alam liar.
Penelitian dimulai dengan sungguh-sungguh mulai hari ini dan akan berlanjut hingga Maret 2022.
